《橫濱購物紀行》的故事背景設定為一個風平浪靜的末世時代，人類文明在遭受大規模氣候災變之後已經接近消亡。劇中並未詳細解釋發生了何等災害，但海平面顯著地不斷上升，使橫濱這樣的港口城市沉入水下，富士山也在災變中改變形狀成為破火山口。地球上的人口大為減少，剩下的人類普遍過著悠閒的生活。雖然文明的滅亡近在眼前，但沒有英雄人物站起來抗爭，劇中的人類平靜地接受了這一命運。 初瀨野阿爾法是一個開咖啡店的女性機器人，店名「Cafe Alpha」，位於三浦半島西南方一個偏僻且交通不便的懸崖邊。她的男性「主人」外出旅行後從不露面，使阿爾法獨守罕有客人上門的咖啡店，但後者卻擁有樂觀的生活態度。作為機器人的阿爾法是沒有壽命限制的。 《橫濱購物紀行》的大部分內容都是關於阿爾法生活中的瑣碎小事，或獨處，或陪伴客人、外出訪友。每隔一年或數年阿爾法會去橫濱購買咖啡店的用品，這便是標題《橫濱購貨紀行》的由來。幾乎所有劇情都由煮咖啡、閒聊、拍照、修理模型飛機引擎之類無關緊要的活動構成，經常在一整篇中只有少數幾句對話。作者擅長在劇情中強調時間的流逝導致的變遷，如咖啡屋即將被海面吞沒，鄰家的孩子長大離家等等細節，表達依依不捨的感情。