主角櫻羽一時是一個普通的男孩，他本來認為忍者是不存在的。 他本應該過着正常，幸福與美好的日子...... 有一天，一時被人盯上了性命，並得知這都是甲賀忍者的所作所為。 為什麼一時會被人盯上呢？因為他是伊賀忍者的第十九代合法繼承人！ 伊賀和甲賀長年來處於對立的立場，甲賀一直都想要侵略伊賀。 一時為了活下去，也只能讓自己成為忍者！ 就這樣，一時投身到了無人知曉的忍者世界中。 為了成為一個成熟的忍者，不斷地學習、戰鬥，直面困難。 但這只是一時殘酷命運的開始……