三門市，人口28萬人。某一天，通往異世界的門在這裡打開了。從異世界而來的侵略者「近界民」，任意蹂躪門附近的地區，讓整座都市陷入恐懼之中。 就在每個人都認為都市毀滅只是早晚的問題時，突然出現一個神秘的團體擊退了近界民。 被稱為境界防衛組織「BORDER」的他們，在這邊的世界建立了巨大的基地，以對抗陸續來襲的近界民。四年後，近界民空閒遊真從異世界來到日本尋找父親的熟人，並認識了三雲修。 修為了解近界民的真相，決定指引及監視人生路不熟的游真，兩人的故事隨着「BORDER」與「近界民」的戰鬥展開。